La Basilica di Bonaria sorge di fianco all'antico Santuario. I lavori ebbero inizio nel 1704. Il progetto originario fu dell'ingegnere Antonio Felice de Vincenti.
Nel corso dei secoli il progetto assunse un'impronta marcatamente neoclassica.
La Basilica presenta una pianta a croce latina ed č divisa in tre navate, le navate laterali sono separate da quella centrale da imponenti colonne binate in bianco calcare.
All'interno del Santuario, nell'altare maggiore, č conservata la statua della Madonna di Bonaria. La leggenda racconta di una nave costretta ad alleggerire il carico, per una tempesta durante la navigazione dalla Spagna all'Italia. I frati Mercedari raccolsero una cassa in legno contenente la statua della Madonna. Proprio in quel momento, la tempesta si placo' e l'equipaggio fu salvo.